果樹基因組序列圖譜

華中農業大學近日對外公佈了甜橙全基因組序列圖譜。華中農大的園藝學、基因組學、生物信息學科研人員經過一年多的努力，破解了甜橙基因“密碼”，完成了甜橙基因組拼接與註釋，獲得了較高質量的甜橙基因組。

據瞭解，這是中國自主完成的第一個果樹作物基因組序列圖譜，也是世界上目前最爲完整的甜橙全基因組序列圖譜。

課題牽頭人、中國工程院院士、華中農業大學鄧秀新教授說：“中國作爲柑橘栽培、生產的第一大國，甜橙全基因組序列圖譜繪製完成，標誌着中國在生物技術和功能基因組合上搭建起一個很好的科研平臺，也對促進柑橘的品種改良，全面提升產業競爭力具有重要意義。”

中國是世界上重要的柑橘原生中心，柑橘栽培歷史可追溯到４０００年前。根據中國農業部公佈的數據，２０１０年中國總產量２６４５萬噸，種植面積爲２２１萬公頃，是世界柑橘第一生產大國。

鄧秀新院士說，中國雖然是柑橘生產的第一大國，但目前栽培的柑橘品８０多個品種中有４０％來自國外，而柑橘產量的５０％也是由國外品種產生。中國需要在柑橘基因技術的基礎研究取得突破，加快品種改良步伐，從而提升產業的核心競爭力。

華中農業大學此次甜橙基因組測序採用全基因組鳥槍法（ＷＧＳ）策略，進行雙末端測序，得到數據總量約爲２００Ｇ，拼接後的序列覆蓋８７％的柑橘基因組，獲得註釋的基因近３萬個。

鄧秀新說，甜橙基因組序列圖譜的完成，如同打開了甜橙生命活動的“黑匣子”，破解了甜橙基因“密碼”，得到了基因組合的排列順序和相關特徵。這爲今後研究中有意識地鎖定甜橙成熟期、色澤、含糖量、產量、抗病性等農藝性狀提供了良好的基礎，有利於培養出更好、更健康的品種來。

此次甜橙全基因組序列圖譜使中國在柑橘基因的基礎研究上與國際先進水平接軌。“我們在有些領域的研究上還有中國自己的特點。”鄧秀新說，“這爲中國將來的生物技術發展提供更好的基礎，也有利於提升中國柑橘研究的國際地位。”